■2003年12月3日
曾培炎副总理批示要求“环保总局会同国土资源部就我国部分地区土壤地球化学状况恶化，查清异常原因，并提出综合治理的意见”。
■2004年
国家环保总局会同国土资源部研究制定《全国土壤现状调查及污染防治专项工作实施方案》，并征求国家发改委、农业部、财政部、科技部、质检总局和法制办意见。
■2004年12月
国家环保总局、国土资源部联合向国务院报送《关于开展全国土壤现状调查及污染防治专项工作的请示》。
■2005年4月29日
国务院办公厅提出了“原则同意有关部门提出开展《全国土壤现状调查及污染防治专项工作》的计划，建议国家环保总局、国土资源部按统筹规划、分工协作、避免重复、资源共享的原则，进一步明确调查技术规范和任务分工，修改和完善具体调查方案”的意见，该意见经温家宝总理圈阅。
■2005年3－12月
国家环保总局在沈阳、南京和广州市组织开展了土壤污染调查试点工作。
■2005年11月9日
国家环保总局、国土资源部在北京联合召开了《全国土壤现状调查及污染防治专项工作总体实施方案》专家论证会。6位院士、4位研究员和9位财务专家一致同意通过该方案，并建议国家作为优先项目予以安排。
■2005年11月17日
国家环保总局第二十二次局务会议审议通过了《全国土壤现状调查及污染防治专项实施方案(环保总局部分)》。
■2005年
财政部安排2000万元专项启动资金，用于支持项目各项准备工作。
■2006年1月
国家环保总局、国土资源部联合向财政部报送全国土壤现状调查及污染防治项目预算。
■2006年2月
成立国家环保总局全国土壤现状调查及污染防治专项工作领导小组，下设办公室，负责土壤调查的日常工作。
■2006年4月
国家环保总局在沈阳、济南和杭州分片召开了全国土壤调查技术讨论会，征求地方对全国土壤污染状况调查具体工作方案和调查技术规定的意见。
■2006年5月25日
吴晓青副局长主持召开全国土壤现状调查及污染防治项目专家咨询会，国内土壤和环境学界的6位院士和5位知名专家对全国土壤现状调查项目方案设计与组织实施提出咨询建议。
■2006年7月18日
国家环保总局召开全国土壤污染调查工作视频会议。周生贤局长出席会议并发表重要讲话，强调采取有效措施，保障土壤环境安全和人体健康；吴晓青副局长对全国土壤污染状况调查工作进行了部署；财政部经建司胡静林司长对用好中央财政专项资金提出了具体要求。
